一种名为NicheCompass的人工智能(AI)工具能够快速分析患者样本中的数百万个细胞,预测组织中的分子变化,帮助制定个性化癌症治疗方案。该工具由英国威康桑格研究所领导的一个研究团队开发,结合了生成式AI和空间基因组数据,首次实现了对细胞“社交网络”的可视化和解读。

NicheCompass通过分析细胞间的通信网络,识别不同细胞邻域的特征,帮助研究人员理解细胞如何相互作用。该工具已在乳腺癌和肺癌患者中展示了其潜力,能够在一小时内分析患者数据,揭示个体对治疗的不同反应,并为个性化治疗提供依据。

单细胞和空间基因组技术的进步使得研究人员能够创建详细的细胞图谱,揭示细胞类型、位置及其相互作用。然而,解读这些复杂的细胞网络一直是一个挑战。NicheCompass通过深度学习模型,量化并解读细胞邻域,帮助研究人员提出关键问题,例如“肺癌细胞如何与周围环境通信?”

研究团队使用NicheCompass分析了10名肺癌患者的数据,发现了患者间的相似性和差异性。相似性有助于理解癌症的普遍机制,而差异性则为个性化治疗提供了新方向。此外,该工具还成功应用于包含840万个细胞的小鼠大脑图谱,展示了其在全器官分析中的潜力。

NicheCompass的开发者表示,该工具不仅利用了AI的强大计算能力,还提供了高度的可解释性,使研究人员和临床医生能够更好地理解疾病机制,并开发针对性的治疗方案。未来,NicheCompass有望在癌症治疗中发挥重要作用,帮助医生制定个性化治疗计划,甚至利用患者的免疫系统直接对抗癌症。

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